Los principales residuos masivos en las operaciones mineras varían en función de los procesos productivos. El Tesoro genera principalmente pilas de ripios y mantiene botaderos de estériles asociados a la explotación de las minas. En 2009 se realizaron estudios preliminares para optimizar la disposición de ripios del proceso de lixiviación.

Los impactos asociados, principalmente por la disposición de los residuos masivos mineros, son sobre el suelo y el paisaje.

En relación a los residuos domésticos Minera El Tesoro ha implementado diversas iniciativas para reciclar, reusar y reducir la generación. Durante 2009, se continúo con el reciclaje de los residuos industriales reciclables, ampliando las empresas autorizadas validadas en la empresa. En este ámbito, cabe destacar el reconocimiento recibido por la compañía, en 2009, para su Planta de Compostaje.